上海市结核（肺）重点实验室是依托于同济大学附属上海市肺科医院，于二○○四年十二月经上海市科委批准成立的。其前身是上海市肺科医院结核基础实验室。该实验室成立于二○○一年，历经四年的快速发展，已经在结核病快速诊断和耐药性检测研究领域取得了显著的进展。

　　 目前实验室主要围绕国际结核病研究的二个焦点――结核病的快速诊断和耐药性测定技术研究以及耐多药结核病的快速诊断和耐药机制进研究。

　　 目前，重点实验室由结核基础实验室、结核病研究室、分枝杆菌室三部分组成，涵盖结核病研究的基础、临床和检验三个方面。实验室研究人员中具有高级职称者4名、中级职称者6名、初级职称8名；具有硕士及以上学位者6名；其中硕士导师2名，每年从同济大学和苏州大学招收内科学及病原微生物学的硕士研究生。此外还接受来自全国各地的联合培养研究生和进修生。

　　实验室拥有结核病细菌学、分子生物学研究所需的基本仪器和设备（如生物安全柜、高速冷冻离心机、超低温冰箱、凝胶图像分析仪、PCR扩增仪等）；还具有国际最先进的结核病基因诊断、菌种鉴定检测仪Gen-Probe。

　　实验室建有结核分枝杆菌菌株库和非结核分枝杆菌菌株库，库存有大量结核分枝杆菌和非结核分枝杆菌临床分离株及其相关研究的背景资料。

　　 近年来与复旦大学遗传所、复旦大学附属华山医院传染病研究室、复旦大学公共卫生学院流行病教研室、中国科学院微系统与信息技术研究所、国家药品生物制品检定所结核菌室、香港大学微生物教研室、第二军医大学微生物教研室、上海市疾病预防控制中心结核病防治科、上海生物制品研究所以及上海的一些从事生物技术研究的公司或企业建立了友好合作研究关系。